Манастирът е действащ мъжки и се намира на 9 км. от Берковица. Има статут на отделно селище. Четвърти е по големина в България. Разположен е в склоновете на връх Тодорини кукли в Западна Стара планина. Основан е през 13-ти век, като по време на османското робство многократно е разрушаван. Възстановен е в края на 19-ти век. При основаването си манастирът е наречен Пустиня. В близък до сегашния си възрожденски стил е възобновен през 17-ти век от първия ктитор и игумен на манастира архимандрит Антим Дамянов. Църквата и манастира са реставрирани през 1937 г. , в който последен вид са се запазили до днес. Иконостасът е истинско творение в български възрожденски дух на Самоковската и Дебърската школа. Иконите в стария храм датират от 18-19-ти век и повечето от тях са дело на зографа Никола Образописов. През 2000 г. в аязмото на Клисурския манастир е открита т. нар. Жива вода, която идва от връх Тодорини кукли. Живата вода е изворна, с ниско съдържание на минерали и се смята за лековита. Клисурският манастир предлага отлични условия за почивка и туризъм. Манастирският комплекс разполага със стаи с 80 легла и два апартамента. Стаите са със санитарен възел. Ресторантът предлага традиционни български ястия с продукти от стопанството на Светата обител. Освен настаняване и храна се предлагат и планински излети, конна езда, фолклорни концерти, приготвяне на обредни хлябове.